EMAN es una suite de herramientas de proceso de imágenes científicas apuntadas principalmente a la comunidad de microscopia de electrón de transmisión, aunque ella comience a estar usado en otros espacios también. Esto tiene un foco particular en la realización de una tarea conocida como la reconstrucción de partícula sola.

En este método, las imágenes de moléculas nanoscale y ensamblados moleculares empotrados en el hielo (vítreo) vítreo son coleccionadas en un microscopio de electrón de transmisión, luego trataron la utilización EMAN para producir 3er recosntruction completo en resoluciones que ahora se acercan a la resolución atómica. Para estructuras de resolución bajas (~2 nm), esto puede requerir ~8 horas del procesamiento de ordenador y unos miles de partículas.

Para estructuras apuntadas a ~0.5 nm o mejor resolución, cientos de miles de partículas y cientos de miles de horas de la unidad central de proceso (en racimos computacionales grandes) pueden requerirse. En efecto, EMAN a menudo está usado en instalaciones supercalcular como una aplicación de prueba para la informática en gran escala.

El proceso de imágenes científico es distinguido del proceso de imágenes de Fototienda típico en el cual es analyitical en la naturaleza. Las imágenes tratadas en EMAN fundan imágenes de escala de gris de punto. Es decir los valores de píxel en las imágenes son representados como números reales, no como pequeños números enteros (las imágenes GIF/JPG/PNG típicas son limitadas con valores integrales de 0-255 para cada píxel).

El procesamiento a menudo incluye operaciones de proceso de imágenes complejas en el espacio de Olita o Fourier. EMAN fue primero liberado en 1999, y ha sido en el desarrollo continuo desde entonces. Esto consiste en un C ++ la biblioteca de cientos de algoritmos de procesamiento de imagen/volumen diferentes con bindings en el Pitón popular scripting lengua. En el nuevo desarrollo de EMAN, todos los programas de nivel del usuario (de que hay más de 200 en EMAN 1.8) son desarrollados en el Pitón, permitiendo al usuario final knowledgable hacer modificaciones sin necesidad tener de descargar o compilar cualquiera de los C ++ código fuente.

Whats Nuevo en Esta Liberación:

· mejoras Sustanciales fueron hechos en refine2d.py.
· Usando refine2d.py en todos los nuevos conjuntos de datos es fuertemente sugerido.
· Algunos programas usan el estilo de EMAN2 de argumentos, es decir "programan <archivo> - option=value", más bien que el viejo estilo, "programa <archivo> option=value".
· hay un nuevo formato de HDF5 compatible con EMAN2.
· Nuevos programas de AIRE fueron añadidos, como "el esqueleto".
· Nuevas opciones fueron añadidos para hacer el trabajo de refinamiento mejor en objetos de icosahedral grandes.
· la infraestructura de paralelismo fue mejorado, aunque los problemas relacionados con la red todavía puedan existir.
· generación modela Arbitraria en makeinitialmodel.py fue fijado.